PEM ja AEM viitavad kahele erinevat tüüpi elektrolüütidele, mida kasutatakse kütuseelementides. PEM tähistab Proton Exchange Membrane, AEM aga anioonivahetusmembraani.
Peamine erinevus PEM-i ja AEM-i vahel on ioon, mida nad transpordivad. PEM-id transpordivad prootoneid, AEM-id aga anioone. PEM-kütuseelemendis juhitakse vesinikgaas üle plaatina katalüsaatori, mis jagab vesiniku molekulid prootoniteks ja elektronideks. PEM võimaldab läbida ainult prootoneid, samal ajal kui elektronid on sunnitud voolama läbi välise vooluringi, tekitades elektrit. Teisest küljest juhitakse AEM-kütuseelemendis hapnik gaas üle katalüsaatori, mis tekitab hüdroksiidioone. AEM laseb läbi ainult hüdroksiidioonid, samas kui positiivselt laetud ioonid on sunnitud voolama läbi välise vooluringi, tekitades elektrit.
Teine erinevus PEM-i ja AEM-i vahel on nende töötingimused. PEM-id vajavad nõuetekohaseks toimimiseks suhteliselt madalat temperatuuri (umbes 80-100 kraadi) ja niisket keskkonda. AEM-id seevastu võivad töötada kõrgematel temperatuuridel (kuni 120-150 kraadi) ega vaja niisket keskkonda.
Toimivuse osas on PEM-idel suurem võimsustihedus ja efektiivsus kui AEM-idel, kuid nende tootmine on ka kallim. AEM-e on seevastu odavam toota, kuid nende jõudlus on madalam.
Üldiselt sõltub valik PEM-i ja AEM-i vahel kütuseelemendi rakenduse spetsiifilistest nõuetest. PEM-e kasutatakse tavaliselt autotööstuses, samas kui AEM-e kasutatakse sageli statsionaarsetes rakendustes, näiteks hoonete varutoitesüsteemides.
